自从8月8日召开市防汛会议后,同江市卫生系统就进行一线防汛工作部署。同江市卫生局局长张金先包扶了三村镇头村,帮助与指导了村里的防汛工作,随后张金又包扶汛情较严重的银川乡银河村与振兴村,驻扎在一线12昼夜,帮助转移村民149户,共517人,其中三户妥善安排在灾民安置点。从20日开始,按照同江市委的要求,各单位成立了巡堤队与大坝防汛队,疾控中心组织了6人的巡堤队,卫生监督所组织了6人的巡堤队积极参与到日常一道坝建筑与维护工作。27日早3:00卫生局组织了50人的突击队,参与同江市城区二道坝的修筑工作中,奋战16小时完成150米的堤坝修筑。9月4日,市委召开了巡堤动员会议,要求副科级干部每天都要24小时在堤坝上进行巡堤,查看管涌。卫生局副局长王文军带队到三村段每天晚上进行值班,白天到各安置点进行查看医疗救治工作。
9月1日,同江市卫生局党委牵头组织七个党委组成的慰问团向坚守在抗洪一线的省武警总队的1100名官兵送去亲切的慰问,带着对官兵的深情厚意,向他们送去药品、月饼、饮料、罐头、水果、八宝粥等价值三万元的慰问品。4日,卫生局组织组织了一台文艺节目到三中武警官兵驻地进行了慰问演出,受到官兵的欢迎。